1) Description d'un modèle

Cliquer sur les boutons marqués d'une croix pour mettre en évidence sur le modèle la structure décrite dans le texte.

Exemple de l'arabinose

L'arabinose possède un squelette  ) de cinq carbones: c'est un pentose. Comme le glycéraldéhyde, sa fonction la plus oxydée est un aldéhyde  en rouge sur la formule ci-dessus) désignant par convention le carbone n°1 du squelette. Il y a trois fonctions alcool secondaire  en vert sur la formule ci-dessus) qui définissent trois carbones asymétriques  ): les carbones n°2, n°3 et n°4. Le carbone n°5 porte un alcool primaire  en bleu sur la formule).

 Rétablir le modèle).

L'arabinose possédant trois carbones asymétriques est, comme le glycéraldéhyde, une molécule chirale


Différentes représentations

 ) Le modèle compact ou CPK (Corey-Pauling-Koltun) permet d'approcher la forme globale de la molécule dans l'espace. Les atomes y sont représentés avec leur rayon de Van der Waals.

 ) Le modèle éclaté utilise des boules et des bâtons pour figurer les atomes et leurs liaisons. Les dimensions y sont arbitraires mais les relations entres groupes fonctionnels sont plus faciles à voir.

 ) Le modèle de Dreiding ne montre que les liaisons. Les atomes n'y sont représentés que par leurs couleurs. Ce modèle est surtout commode pour l'étude des conformations.

 ) Le modèle fil de fer est un modèle de Dreiding simplifié qui permet d'afficher et de manipuler à l'écran de très grosses structures (protéines, acides nucléiques) sans être géné par les autres figurations.